判斷原代細胞是否污染?需結合肉眼觀察、顯微鏡檢查與專項檢測，培養基渾濁、顏色變黃、鏡下可見快速運動的微小顆粒或絲狀菌絲是主要判斷依據。
一、肉眼觀察（初步判斷）
在換液或傳代前，首先觀察培養基狀態：
渾濁度：正常培養基清澈透明，若出現霧狀或乳白色渾濁，提示可能為細菌污染。
顏色變化：培養基由粉紅/紅色變為黃色，說明pH下降，常見于細菌代謝產酸；少數真菌污染可能導致變紫。
沉淀或漂浮物：出現白色、黃色顆粒沉淀（細菌聚集）或?棉絮狀、絲狀漂浮物?（真菌菌絲），可直接判定污染。

二、顯微鏡觀察（精準確認）

在100–200倍倒置顯微鏡下觀察細胞間隙和形態：
細菌污染：視野中可見大量微小桿狀或球狀顆粒，并在細胞間隙快速運動，細胞逐漸變圓、脫落。
真菌污染：可見絲狀菌絲、圓形孢子或棉絮狀菌落，菌絲常纏繞細胞，導致增殖停滯。
支原體污染：普通光學顯微鏡難以直接觀察（體積僅0.1–0.3μm），但可間接發現細胞?空泡增多、增殖緩慢、貼壁差?等異常狀態。
注意：支原體污染隱蔽性強，若細胞長期生長不良但無明顯微生物跡象，建議使用?PCR或熒光染色法進行專項檢測。