一、實驗前準備(試劑準備區(qū))
試劑解凍與混勻
將試劑盒各組分從-20℃冰箱取出,在冰上緩慢融化后,短暫離心使液體沉于管底,充分混勻。
分區(qū)操作要求
實驗應(yīng)在獨立的三個區(qū)域進行:
試劑準備區(qū)(配制PCR反應(yīng)液)
樣本處理區(qū)(提取DNA)
PCR擴增區(qū)(上機檢測)
各區(qū)實驗服、移液器、吸頭應(yīng)專用,避免交叉污染。
使用帶濾芯吸頭?,防止氣溶膠污染。
二、樣本處理(樣本處理區(qū))
樣本類型
可使用皮膚刮屑、指甲碎片、毛發(fā)或培養(yǎng)菌落等。建議先進行增菌培養(yǎng)以提高檢出率。
DNA提取
使用市售DNA提取試劑盒或試劑盒配套的裂解液進行核酸提取。
若使用快速裂解法:將約100 mg樣本加入0.1 mL溶液A,95℃保溫10–15分鐘,再加0.1 mL溶液B混勻,取上清作為模板。
提取后DNA應(yīng)立即使用或-20℃保存。
設(shè)置對照
樣品制備陽性對照:在適量水中加入10 μL陽性對照的1000倍稀釋液。
樣品制備陰性對照:僅用水作為空白。
每批實驗至少設(shè)置一個N+2樣本(N為待測樣本數(shù))。
反應(yīng)管標記與加樣順序:
標記N+4個PCR管(N個樣品 + 1個PCR陰性對照 + 1個PCR陽性對照 + 2個標準品管,如需定量)
先加入PCR Mix和引物,再依次加入模板
最后加入陽性對照?,防止污染